Nová metoda umožní včasnou diagnostiku rakoviny slinivky břišní
Naši vědci se významně podíleli na objevu nové diagnostické metody včasného záchytu rakoviny slinivky břišní.
Aktuality
Zajímavosti
-
ČR jako členský stát mezinárodních výzkumných infrastruktur v reakci na SARS-CoV-2 / Covid-19
Epidemie nového druhu koronaviru SARS-CoV-2 a jím způsobeného onemocnění Covid-19 vyvolala po celém světě zdravotní, sociální a ekonomické dopady v posledních desetiletích zcela bezprecedentního rozměru. Opatření zmírňující okamžité dopady této pandemie, jakož i reakce přinášející efektivní řešení výzev touto pandemií vyvolaných, musí být nutně znalostní povahy, tj. založená na datech a poznatcích z těchto dat vyplývajících. Jednu ze stěžejních rolí v tomto kontextu hrají výzkumné infrastruktury, jež vědecké komunitě zpřístupňují nejpokročilejší znalostí, technologické a datové zdroje, které účinný boj se SARS-CoV-2 / Covid-19 vyžadují. Výrazný multiplikační efekt přitom přináší výzkumné infrastruktury mezinárodního rozsahu, charakteru a významu, jež v rámci svých kapacit koncentrují kritické množství zdrojů pro realizaci nejnáročnějších vědeckých experimentů a studií, a tyto zdroje zároveň zpřístupňují svým uživatelům na nadnárodní úrovni umožňující rozsáhlé mezinárodní kolaborace. ČR, jakožto členský stát řady mezinárodních výzkumných infrastruktur, je integrální součástí úsilí, které je celosvětovou výzkumnou komunitou v reakci na pandemii SARS-CoV-2 / Covid-19 rozvíjeno. Ať už se jedná o mezinárodní organizace výzkumu, vývoje a inovací, ustavené na základě mezinárodního práva veřejného, tak o konsorcia evropských výzkumných infrastruktur, založená podle právního rámce EU, ČR vystupuje ve střetu se SARS-CoV-2 / Covid-19 jako aktivní člen vedoucích světových laboratoří. Níže uvedená zařízení poskytují svým uživatelským komunitám svá rozsáhlá experimentální a datová zázemí na bázi otevřeného přístupu, přičemž v nynější situaci, žádající si urychlená znalostní řešení, velmi často i na základě preferenčního přístupu, upřednostňujícího provádění studií souvisejících s pandemií SARS-CoV-2 / Covid-19 před výzkumnými pracemi ostatní povahy. EATRIS-CZ – Český národní uzel Evropské infrastruktury pro translační medicínu EATRIS ERIC (European Advanced Translational Research Infrastructure in Medicine) a jeho členové včetně EATRIS-CZ (Český národní uzel Evropské infrastruktury pro translační medicínu), poskytují výzkumně-infrastrukturní zázemí k vývoji léčiv, vakcín a diagnostik, a to až k úrovním tzv. „prvního podání u člověka“ a jejich klinickému ověření „proof-of-concept“. EATRIS ERIC je partnerem v rámci projektu TRANSVAC-2 financovaného EU, který urychluje vývoj vakcín proti SARS-CoV-2. ECRIN-ERIC (European Clinical Research Infrastructure Network) ve spolupráci se svými národními partnery, mezi které náleží také CZECRIN (Český národní uzel Evropské sítě infrastruktur klinického výzkumu), ustavil pracovní skupinu COVID-19, jež se věnuje zrychlenému postupu pro poskytování služeb v oblasti klinických studií souvisejících s onemocněním Covid-19. BBMRI-ERIC (Biobanks and Biomolecular Resources Research Infrastructure Consortium) a členské národní uzly, včetně BBMRI-CZ (Banka klinických vzorků), poskytují specifické informace o zdrojích, které mohou zpřístupnit vědcům z akademického prostředí i ze soukromého sektoru pracujícím na vývoji vakcín a léčiv SARS-CoV-2 / Covid-19. Síť více než 600 bio-bank sdružených v rámci BBMRI-ERIC poskytuje vědcům v tomto ohledu naprosto klíčové služby. EATRIS ERIC, ECRIN-ERIC a BBMRI-ERIC ustavily společnou platformu COVID-19 Fast Response Service, jako vzájemně koordinovanou proceduru pro výzkumné pracovníky k získání urychleného přístupu k akademickým zařízením, službám a zdrojům těchto tří výzkumných infrastruktur, které spolupracují i pod záštitou aliance AMRI (Alliance of Medical Research Infrastructures). CZECRIN – Český národní uzel Evropské sítě infrastruktur klinického výzkumu EU-OPENSCREEN ERIC (European Infrastructure of Open Screening Platforms for Chemical Biology) se aktivně podílí na řadě aktivit zaměřených na studium koronaviru SARS-CoV-2, identifikaci léčiv onemocnění Covid-19 a vývoje diagnostiky. EU-OPENSCREEN ERIC a Evropská chemicko‑biologická databáze, provozovaná CZ‑OPENSCREEN (Národní infrastruktura pro chemickou biologii), jsou pak i partnery návrhu projektu EUROCOVID k podpoře z rámcového programu Horizontu 2020. Euro-BioImaging ERIC (European Research Infrastructure for Imaging Technologies in Biological and Biomedical Sciences) a její český uzel Czech-BioImaging (Národní infrastruktura pro biologické a medicínské zobrazování) poskytují zobrazovací technologie k realizaci biologického a lékařského výzkumu. Podrobné informace o službách poskytovaných v reakci na pandemii onemocnění Covid-19 zveřejnil Euro-BioImaging ERIC na vyhrazené webové stránce. Instruct-ERIC (Integrated Structural Biology European Research Infrastructure Consortium), jehož součástí je rovněž CIISB (Česká infrastruktura pro integrativní strukturní biologii), zveřejnil katalog instrumentace podporující výzkum SARS-CoV-2 / Covid-19. Řada služeb Instruct-ERIC je dostupná přes vzdálený přístup bez nutnosti doručit vzorky k analýze osobně. Bližší informace jsou k dispozici na webovém portálu Instruct-ERIC Covid-19 Resource Centre. ELIXIR (European Life-Science Infrastructure for Biological Information), jehož českým partnerem je ELIXIR-CZ (Česká národní infrastruktura pro biologická data) v souvislosti s pandemií SARS-CoV-2 ustavil informační webovou stránku o podporovaných servisech. Případné související dotazy lze adresovat na lauer@elixir-europe.org. CIISB – Česká infrastruktura pro integrativní strukturní biologii EMBL (European Molecular Biology Laboratory) již od prosince 2019 shromažďuje a zpracovává data týkající se viru SARS-CoV-2. Přes svoji bio-informatickou pobočku EMBL-EBI, která je zároveň největším evropským úložištěm molekulárně-biologických dat, pak EMBL vytvořila specializovanou webovou stránku, která pomáhá ukládat a sdílet data o viru SARS-CoV-2 do dalších molekulárních databází. Vědci mohou získat podporu před odesláním svých dat na virus-dataflow@ebi.ac.uk. Jakékoliv dotazy týkající se tohoto tématu lze adresovat na contact@virusresource.embl.org. CERN (European Organisation for Nuclear Research) ustanovila zvláštní pracovní výbor posuzující možnosti využití technologií a kompetencí CERN ke globálnímu úsilí v boji s Covid-19. Návrhy pro tuto skupinu mohou být zasílány na adresu covid@cern.ch. Další informace jsou dostupné na webových stránkách CERN. ESA (European Space Agency) vyhlásila 2 nové iniciativy zaměřené na porozumění dopadů nemoci Covid-19 na společnost, ekonomiku a životní prostředí. Jedna z nových výzev je součástí elementu „Věda pro společnost“ programu ESA na pozorování Země. Kromě této výzvy ESA ve spolupráci s Evropskou komisí spustila i zvláštní díl soutěže “Custom Script Contest”, zaměřené převážně na využití dat z družic Sentinel. Soutěž je zaměřena pro experty v oblasti dálkového průzkumu Země, strojového učení i odbornou veřejnost, jež mohou předkládat návrhy, jak by družicová data mohla přispět ke zmírnění dopadů pandemie v ekonomických sektorech, jakými jsou průmysl, obchod, doprava či zemědělství, ale je otevřena rovněž pro jiné nápady. Vzdělávací sekce ESA spustila portál Expedice: Doma, jež má dětem a rodičům pomoci s domácím učením a se zábavou s využitím témat z kosmonautiky. CESSDA ERIC (Consortium of European Social Science Data Archives), ve kterém je ČR zastoupena skrze CSDA (Český sociálněvědní datový archiv), podporuje Průzkum pracovního života CORONA, organizovaný Nadací WageIndicator. Průzkum se věnuje mapování změn životních a pracovních podmínek vyvolaných pandemií v 110 zemích světa. CLARIN ERIC (Common Language Resources and Technology Infrastructure), jehož se v roli českého uzlu účastní LINDAT/CLARIAH-CZ (Digitální výzkumná infrastruktura pro jazykové technologie, umění a humanitní vědy), pak poskytuje nadaci Wagelndicator pro tento průzkum hostitelskou platformu. EMBL – Evropská laboratoř molekulární biologie
-
CzechBioImaging reaguje na pandemii SARS-CoV-2 / Covid-19
In connection with the SARS-CoV-2 / Covid-19 pandemic spread, Czech-BioImaging (National Research Infrastructure for Biological and Medical Imaging), as the Czech national node to the Euro-BioImaging (European Research Infrastructure for Imaging Technologies in Biological and Biomedical Sciences) pan-European network, offers: * No fees for Covid-19 relevant scientific projects selected for implementation within the ongoing call for the Czech-BioImaging Open Access support (July 2020 – June 2021). The current call also aims to help solve any scientific aspect connected with Covid-19. Scientifically relevant projects, which need imaging methods, will be given a prioritised access to Czech-BioImaging facilities with no fees attached. Deadline for submitting applications is 30th April 2020. More information and the application rules can be found at Czech-BioImaging website. * For open access, priority is given to projects addressing Covid-19 issues. More information as well as application form may be found at dedicated Czech-BioImaging web page. Czech-BioImaging is a distributed research infrastructure of imaging institutions in the Czech Republic. It provides open access to a wide spectrum of imaging technologies and methodologies, allowing for the extraction of completely new scientific data, especially in cell and molecular biology, genetics, physiology, parasitology, tumour biology, neurosciences, developmental biology, and pathology. Czech Republic has been a founding Member of the Euro-BioImaging ERIC. CzechBioImaging – National Research Infrastructure for Biological and Medical Imaging
-
METROFOOD-CZ nabízí informace a analýzy z oblasti potravin a zemědělské výroby
METROFOOD-CZ je výzkumná infrastruktura, která se specializuje na potraviny a výživu a zároveň je českým národním uzlem METROFOOD-RI (Infrastructure for Promoting Metrology in Food and Nutrition). V rámci pomoci nabízíme analýzy z oblasti zemědělské prvovýroby, zpracování potravin a technologií s ohledem na kvalitu, autenticitu, bezpečnost a vysledovatelnost potravin, surovin, potravinářských výrobků a doplňků. Tento výzkum je řízen Českou zemědělskou univerzitou v Praze a jejími partnery – Vysokou školou chemicko-technologickou v Praze a Výzkumným ústavem potravinářským Praha. Je nezbytné, aby i v době koronavirové pandemie zůstaly naše potraviny bezpečné. Proto je nutné při jejich výrobě, manipulaci, distribuci, přepravě a prodeji dodržovat správné hygienické postupy, abychom zamezili jejich případné kontaminaci nebo křížové kontaminaci při zachování nutričních a jiných kvalitativních vlastností. METROFOOD-CZ, spolu se zahraničními partnery METROFOOD-RI, poskytuje komplexní hodnocení kvality potravin a doplňků stravy v laboratořích, jako jsou laboratoře chemie a analýzy potravin, nanotechnologií, biotechnologií, mikrobiální analýzy, imunochemie, kvality potravin, výživy a molekulární biologie. V této souvislosti nabízíme odborné rady a konzultace, jakož i využití analytických zařízení, např. GC-QTOF, UHPLC-QTOF, NMR, MALDI-TOF apod. Více informací o METROFOOD-CZ naleznete na www.metrofood.cz a www.metrofood.eu, popř. kontaktujte METROFOOD-CZ na info@metrofood.cz a media@metrofood.cz. METROFOORD-CZ – Infrastruktura pro propagaci metrologie v potravinářství a výživě v ČR
-
Zúčastněte se průzkumu pracovního života CORONA
Nadace WageIndicator informuje o probíhajícím kontinuálním globálním online průzkumu „Život a práce v časech Corony“. Průzkum mapuje změny životních a pracovních podmínek vyvolané novým druhem koronaviru SARS-CoV-2 a onemocněním Covid-19 v celkem 110 zemích světa. Proměny jsou vizualizovány prostřednictvím map a grafů. Infografika přehledně ukazuje den po dni důsledky nynější pandemie, kterým čelí většina pracující světové populace. Průzkum je zpracován na základě odpovědí na několik základních otázek týkajících se probíhající pandemie. Více informací naleznete na webových stránkách CESSDA ERIC (Consortium of European Social Science Data Archives) anebo na webových stránkách nadace Wagelndicator. WageIndicator je nezisková nadace, která si klade za cíl v celosvětovém měřítku sdílet a porovnávat mzdy a pracovní právo prostřednictvím svých webů ve 140 zemích, které navštěvují miliony uživatelů. Wagelndicator je součástí projektu SSHOC (Social Sciences and Humanities Open Cloud), který je koordinován evropskou výzkumnou infrastrukturou CESSDA ERIC. Další evropská výzkumná infrastruktura CLARIN ERIC (Common Language Resources and Technology Infrastructure) poskytuje výzkumným aktivitám WageIndicatoru hostitelskou platformu. ČR se na výzkumných aktivitách CLARIN ERIC podílí prostřednictvím velké výzkumné infrastruktury LINDAT/CLARIAH-CZ (Digitální výzkumná infrastruktura pro jazykové technologie, umění a humanitní vědy), koordinované Univerzitou Karlovou. Do výzkumných aktivit CESSDA ERIC je ČR zapojena prostřednictvím velké výzkumné infrastruktury CSDA (Český sociální datový archiv), jíž koordinuje Sociologický ústav AV ČR, v.v.i. CESSDA ERIC – Consortium of European Social Science Data Archives
-
European Open Science Cloud podporuje boj s Covid-19
EOSCsecretariat.eu systematicky podporuje svými aktivitami vývoj, fungování a řešení specifických potřeb řídící struktury EOSC (European Open Science Cloud). Vysoká míra flexibility a finanční zdroje umožňují reagovat na jednotlivé výzvy v oblasti otevřené vědy. Možnosti financování EOSC sekretariát se zapojuje do podpory řešení současného epidemiologického vývoje ve světe skrze podporu urgentních potřeb výzkumu. Otevřená výzva tak dává možnosti zúčastněným stranám přispět svými výsledky k řešení této situace. Výzva slibuje rychlý administrativní proces. Fyzické a právnické osoby z členských států EU a asociovaných zemí nečerpající finanční podporu z jiných zdrojů (projektů EU nebo projektů národních výzkumných infrastruktur) na dané činnosti, mohou žádat o financování v podobě tzv. „co-creation budget“. Metodika k podávání žádostí včetně definice způsobilých nákladů a formuláře žádosti jsou dostupné na webové stránce EOSC sekretariátu. Podporované aktivity musí využívat principy otevřené vědy a přispívat k poznání, resp. k řešení epidemiologické situace v souvislosti s výskytem Covid-19. K těmto aktivitám patří: * Otevřený přístup k vědeckým datům týkajících se Covid-19; * Sdílení infrastruktur a služeb; * Vývoj otevřených nástrojů sloužící k boji proti Covid-19; * Sdílení metodik k testování vzorků a dat; * Vývoj otevřených metodik, služeb, softwaru a infrastruktur pro sdílení dat, postupů a znalostí v souvislosti s vývojem výskytu a léčbou Covid-19; * Vývoj otevřených metodik pro sledování šíření Covid-19; * Vývoj otevřených metodik a metodik založených na důkazech pro rozvoj politiky se zaměřením na boj proti pandemii Covid-19; * Zpřístupnění a komparace otevřených dat v oblasti eradikace Covid-19 a v souvislosti s chováním a výskytem jiných obdobných virů a případných dalších ohniskových výskytech v budoucnosti; * Posouzení validity epidemiologických data v souvislosti s Covid-19 k zajištění monitoringu a ověření zdrojů nákazy; * Další aktivity v oblasti ověřené vědy související s potlačením epidemie and pandemie. Otevřená věda pomáhá porozumění pandemii Covid-19 Boj proti Covid-19 se stal prioritou ve všech státech Evropy i mimo ni. Zdravotnictví se snaží poskytovat péči v co největším rozsahu. Na základě zkušeností z Itálie či Španělska je ale zřejmé, že nápor pacientů, zejména pacientů s vážným průběhem, sektor zdravotnictví vyčerpává, a to, co se týče pracovních, tak i materiálových kapacit. Celý svět proto očekává, kdy počty nakažených v jednotlivých státech začnou klesat. Bohužel není jasné, kdy se tak stane a zda se tato situace (se stejným či jiným původcem nákazy) nebude znovu opakovat. Vývoj nové diagnostiky, léčby i vakcíny si žádá čas. Pandemie Covid-19 má ale tendenci postupovat rychle. Sdílení dat souvisejících s potlačením této pandemie má v současné době pro biomedicínský výzkum velký význam. Napomáhá sdílení samotných dat výzkumu, avšak i softwaru, metodik monitoringu a sledování vývoje pandemie. Zpřístupnění dat napomůže k poznání v oblastech eradikace Covid-19 a chování obdobných virů. Validace epidemiologických dat nastíní sledování zdrojů nákazy a cestu jejího šíření. Evropská vědecká komunita se v posledních týdnech zaměřuje na téma pandemie Covid-19. Evropské výzkumné instituce poté podepsaly i prohlášení Welcome Trust’s Statement on Data Sharing in Public Health Emergencies. Vyjádřily tímto souhlas s otevřeným přístupem ke všem relevantním výzkumům zaměřující se na Covid-19. Výsledky výzkumu jsou tak k dispozici ještě před jejich peer-review. Světová zdravotnická organizace (WHO) tak i získala rychlý přístup k čerstvým datům, které by mohly napomoci řešení současné situace.
-
CzechNanoLab nabízí své kapacity pro boj s Covid-19 / SARS-CoV-2
Výzkumná infrastruktura CzechNanoLab nabízí své kapacity v boji s onemocněním COVID-19. Nabízíme zejména testování ochranných pomůcek z nanomateriálů, např. analýzu nanovlákenných filtrů, chemickou analýzu aktivních nanočástic atd. Dále nabízíme kapacity pro přípravu magnetických nanočástic pro testování na přítomnost SARS-CoV-2. V neposlední řadě umožníme přednostní bezplatný přístup a podporu všem projektům výzkumu a vývoje, které přímo souvisejí s výzkumem koronaviru SARS-CoV-2 (např. vývoj mikrofluidních čipů pro sekvenování RNA). Požadavky zasílejte na e-mail info@czechnanolab.cz . CzechNanoLab poskytuje otevřený přístup k technologickému vybavení a službám v oblasti nanotechnologií a materiálových věd. CzechNanoLab se skládá ze 2 pracovišť, a to brněnské laboratoře CEITEC Nano a pražské Laboratoře nanostruktur a nanomateriálů (LNSM). Tato 2 pracoviště umožňují rychlý a snadný přístup ke špičkovým přístrojům pro fabrikaci a analýzu nanostruktur, nanomateriálů a nanosoučástek. Nové materiály a nanostruktury vyvíjené v laboratořích CzechNanoLab mohou vést např. k vývoji rychlejších a úspornějších záznamových médií nebo ke včasnější diagnostice chorob. CzechNanoLab je zapojen do evropské výzkumné infrastruktury v oblasti nanofabrikace EuroNanoLab, www.euronanolab.eu. CzechNanoLab Research Infrastructure
-
ELI Beamlines umožňuje výzkum SARS-CoV-2 ve zrychleném režimu
To support the investigation of the SARS-CoV-2 virus characteristics and the development of possible vaccine and treatments ELI Beamlines offers rapid access to the experimental cluster for advanced ultrafast optical spectroscopy and X-ray diffraction for research related to Covid-19. More information about the ELI Beamlines scientific cluster for advanced ultrafast optical spectroscopy and X-ray diffraction can be found HERE. Proposals and experiments will be supported by Research Programme 4 for Applications in Molecular, Bio-medical and Material Science, jointly with the ELIBIO Project teams. More information on available support (bio and bio-chemical) labs is available HERE. Please use the application form to describe the planned experiment. ELI Beamlines has experiences also working with samples delivered for experiments, but without the user being present at the facility. This more of operation can also be used for experiments performed within the present Covid-19 call. ELI Beamlines is a part of the ELI (Extreme Light Infrastructure) pan-European project, representing a unique tool of support of scientific excellence in Europe. ELI Beamlines aims to operate the world’s most intense laser system. With ultra-high power 10 PW and concentrated intensities of up to 1024 W/square cm, ELI Beamlines offer users a unique source of radiation and rays of accelerated particles. These beamlines are enable pioneering research not only in physics and material science, but also in biomedicine and laboratory astrophysics and many other fields. Extreme Light Infrastructure – ELI Beamlines
-
CATPRO nabízí své kapacity v boji s onemocněním Covid-19
Výzkumná infrastruktura CATPRO (Katalytické procesy pro efektivní využití uhlíkatých energetických surovin), vybudovaná nově v rámci kapacit výzkumného a vývojového centra UniCRE, pracuje v oblasti experimentální chemie se zaměřením na přenos laboratorního vědeckého výzkumu do větších, resp. realizačních měřítek, a to s využitím vysoce sofistikovaných pilotních a testovacích aparatur. CATPRO má potenciál – v kontextu událostí odehrávajících se v souvislosti s šířením nemoci Covid-19 – přispět experimentálními výzkumnými pilotními chemickými aparaturami při vývoji prostředků pro zmírnění šíření nemoci Covid-19. Základní charakteristiky experimentálních pilotních jednotek CATPRO jsou následující – nepřetržitý provoz; objem výzkumných reaktorů od 10 do 2000 ml; teploty do 500 °C; tlaky do 20 MPa; možnost studií a výzkumu chemických syntéz, katalytických reakcí typu hydrogenace, selektivní hydrogenace, hydrogenační štěpení, oxidace-redukce, deoxygenace atd. Reaktorové sestavy jsou doplněny pilotními a poloprovozními destilačními kapacitami. Soubor pokusných aparatur je přímo nebo nepřímo napojen na rozsáhlý soubor analytických rozborů prováděných na té vůbec nejmodernější analytické technice. V pilotních podmínkách je možné provádět chemické operace s objemem v řádu desítek až stovek litrů. Výzkumná infrastruktura CATPRO, ustavená v rámci kapacit výzkumného a vývojového centra UniCRE, představuje unikátní infrastrukturu pro výzkum, vývoj a inovace v ČR i mezinárodním měřítku. CATPRO představuje plně transparentní prostředí, které poskytuje komplexní kapacity a zdroje pro získávání vědeckých poznatků v chemii a pro přenos laboratorních výsledků do realizačních měřítek. CATPRO – Katalytické procesy pro efektivní využití uhlíkatých energetických surovin