Nová metoda umožní včasnou diagnostiku rakoviny slinivky břišní
Naši vědci se významně podíleli na objevu nové diagnostické metody včasného záchytu rakoviny slinivky břišní.
Věda, která mění svět, nevzniká ve vzduchoprázdnu. Stojí za ní desítky tisíc odborníků v tzv. core facilities – sdílených laboratořích, technologických platformách a výzkumných infrastrukturách, které propojují špičkové technologie s lidským know-how. A právě jim patřil mezinárodní kongres CTLS 2025, který se letos v červnu konal v Brně, městě, jež se dnes právem pyšní titulem inovačního hubu a jednoho ze světových lídrů v oblasti elektronové mikroskopie. Na CTLS kongresu, který pořádal CEITEC Masarykovy univerzity pod záštitou evropské asociace CTLS (Core Technologies for Life Sciences), se setkalo více než 250 profesionálů, kteří spravují a rozvíjejí výzkumné infrastruktury ve 25 zemích světa. Diskutovalo se o tématech, která hýbou oborem – od udržitelného řízení sdílených laboratoří, přes nábor a vzdělávání personálu, až po integraci nových technologií, inovací v core facilitách a spolupráci s průmyslem. Výrazným tématem bylo také zajištění správy dat v souladu s evropskými standardy EOSC, obzvlášť s ohledem na citlivost dat v oblasti živých věd. Kongres potvrdil, že úspěšný výzkum se dnes bez kvalitní infrastruktury neobejde. V době, kdy se vývoj nových terapií, diagnostiky nebo materiálů stále více opírá o mezioborovou spolupráci a precizní technologické zázemí, jsou core facilities přirozeným centrem vědeckého dění. O to důležitější je sdílení zkušeností napříč institucemi a zeměmi – právě to umožňuje síť CTLS, která sdružuje nejen lidi na vedoucích či manažerských pozicích, ale i techniky, výzkumníky a administrativní pracovníky, aniž by byla specificky oborově profilovaná. V odborném programu zazněly desítky přednášek a diskuzí, od praktických ukázek řízení core facilit až po strategické pohledy na inovace ve vědě. Jedním z klíčových poselství napříč celým kongresem bylo, že inovace musí vycházet z reálných potřeb, jen tak mají šanci uspět. Neméně důležité byly i diskuze o profesním rozvoji a cíleném vzdělávání a školení pracovníků výzkumných infrastruktur – klíčových pilířích pro zajištění dlouhodobé udržitelnosti, vysoké kvality poskytovaných služeb a dalšího rozvoje výzkumu v oblasti živých věd. Kongres letos přinesl i nové formáty, například úvodní kick-off sekci zaměřenou na networking, která pomohla vytvořit otevřenou a přátelskou atmosféru hned od začátku. „Cílem bylo, aby se lidé cítili vítaní, nestyděli se klást otázky a navazovali nová spojení napříč obory. Myslím, že se to skvěle odrazilo na celkovém průběhu akce, především při panelových diskuzích – tenhle nápad se opravdu osvědčil,“ komentovala hlavní organizátorka Kateřina Hošková z CEITEC Masarykovy univerzity. Závěrečná open mic session pak nabídla prostor pro spontánní sdílení výzev i dobré praxe přímo ze sálu. Vedle oficiálního programu nabídlo CTLS 2025 i prostor pro neformální setkání, včetně gala večera v historickém Augustiniánském opatství doprovázeném prohlídkami Mendlova muzea a baziliky. Akce byla zároveň poctou Spenceru Shorterovi, zakladateli CTLS, který letos náhle zemřel. Jeho vize otevřené, podporující a spolupracující profesní komunity prostupovala programem a stala se i tichým leitmotivem celé akce. „CTLS spojuje lidi, díky nimž se špičkový výzkum stává realitou. Pokud hledáte komunitu, kde můžete sdílet zkušenosti, profesně růst a společně posouvat náš obor dál, pak je CTLS je tím správným místem pro vás,“ shrnula prezidentka asociace Julie Fernandez-Rodriguez. Brněnský kongres potvrdil, že core facilities nejsou jen podpůrnými službami, jsou zásadním hybatelem vědeckého pokroku. Zároveň ukázal, že Evropa, včetně regionů mimo tradiční vědecká centra, má nejen ambici, ale i kapacity hrát v této klíčové oblasti vedoucí roli. CTLS kongres se koná každé dva roky v jiné zemi a cílem tohoto „putování“ je vždy snaha aktivizovat lokální komunitu, dát tématu core facilit jasnou viditelnost a pomoci vytvořit regionální, národní i nadnárodní komunity spolupracovníků. Česká republika je se svou sítí velkých výzkumných infrastruktur v tomto směru na velmi dobré cestě. Další setkání komunity CTLS proběhne v roce 2027 v Miláně. Do té doby ale zůstává otevřený prostor pro spolupráci a sdílení – nejen na kongresech, ale v rámci celoroční aktivity této evropské asociace, která je otevřená i novým členům. Zdroj: : CEITEC MUNI
Ve dnech 21. a 22. května 2025 se v Brně konala mezinárodní konference Research Data Day & EOSC National Tripartite Event, která přivedla dohromady špičky evropského výzkumu, odborníky na datovou vědu, zástupce výzkumných infrastruktur i tvůrce vědních politik. Dvoudenní program, který kombinoval přednášky, panelové diskuse, odborné workshopy i networking, přilákal více než 200 účastníků ze 40 institucí Česka, Rakouska, Slovenska, Německa, Finska a dalších evropských zemí prezenčně i online. Konference nabídla prostor pro sdílení aktuálních poznatků o správě výzkumných dat, fungování výzkumných infrastruktur a využívání umělé inteligence ve vědě v kontextu práce s daty. Zvláštní pozornost byla věnována tématu „data ready for AI“ – tedy tomu, jak připravit výzkumná data tak, aby byla vhodná pro využití v AI systémech, a jak tyto snahy sladit s principy FAIR. Představeny byly také pokroky v implementaci iniciativy European Open Science Cloud (EOSC). Výzkumné infrastruktury a vědecká data jako pilíře evropské vědy O úvodní slovo se podělili Šárka Pospíšilová (prorektorka pro vědu a výzkum Masarykovy univerzity), Luděk Matyska (předseda řídícího výboru projektu IPs EOSC-CZ a hlavní řešitel projektu NRP pro výzkumná data,) a Jan Hrušák (místopředseda Řídicí rady EOSC SB a člen výkonné rady ESFRI), který zároveň moderoval sekci „Shaping the Future of EOSC“. Ta otevřela prostor pro diskusi o národní angažovanosti v evropských strukturách EOSC a zapojení České republiky do formování evropské politiky otevřené vědy. „Ekosystém evropských infrastruktur se rychle vyvíjí a stává se čím dál komplexnějším – od výzkumných a technologických infrastruktur přes e-infrastruktury až po datové prostory či AI Factories. Pro zajištění jejich efektivní spolupráce a provázanosti s národními politikami bude klíčové vytvořit na EU úrovni zastřešující rámec, který umožní koordinaci a strategické směřování v evropském výzkumně-inovačním prostoru po roce 2027.“ shrnul Jan Hrušák. Diskuse se zaměřila na financování, správu a architekturu EOSC v příštím rámcovém programu (FP10), propojení národních a tematických uzlů, i na přenositelnost českého modelu koordinace do evropského měřítka. Své pohledy na problematiku představili Lucie Núñez Tayupanta (MŠMT), Luděk Matyska (CESNET, MU), Matej Antol (MU), Yannis Rodopoulos (Evropská komise) a Kamran Naim (CERN, EOSC Association). Společně zdůraznili potřebu dlouhodobé udržitelnosti, strategického řízení a hlubší integrace vědních politik napříč státy i sektory. „EOSC lze chápat jako meta-infrastrukturu, jejímž hlavním přínosem je schopnost podporovat spolupráci napříč různými vědními obory i výzkumnými infrastrukturami. Skutečný úspěch EOSC bude záviset na tom, zda dokáže propojit tyto aktivity napříč komunitami a vytvořit funkční rámec pro správu a sdílení dat a znalostí“ zaznělo od Luďka Matysky. Panel přinesl unikátní pohledy na budoucnost EOSC po roce 2027 z perspektivy Evropské komise, EOSC Association i zástupců českých institucí, které jsou aktivně zapojené do implementace evropských priorit v oblasti otevřené vědy. Inovace a evropský pohled na data a infrastruktury Mezi hlavní řečníky věnované oblasti výzkumných infrastruktur patřila Jana Klánová (ředitelka RECETOX, PřF MU), která ve svém vystoupení upozornila na zásadní výzvy spojené s výzkumem lidského exposomu. „Jednou z největších výzev v interdisciplinární oblasti výzkumu lidského expozomu jsou kromě potřeby inovativních technologií nebo harmonizace dat i lidské kapacity. Potřebujeme odborníky, kteří dokážou nejen intelektuálně propojit výzkumné oblasti, ale i vědecké a manažerské kompetence, a mají odvahu se pustit do dlouhodobých mezioborových projektů, které nepřinesou rychlé výsledky. Musíme investovat do kvality dat už v počáteční fázi jejich sběru a mít shodu na tom, jakým způsobem je pak budeme propojovat napříč doménami. K tomu je třeba nejen vybudovat odpovídající datovou infrastrukturu, ale zvyšovat povědomí o nových výzkumných směrech a jejich požadavcích na dlouhodobou kvalitu a propojení dat“ uvedla Klánová. Roli velkých jazykových modelů v kontextu otevřené vědy na evropské úrovni přiblížil ve své přednášce Jan Hajič (Univerzita Karlova). Další odborníci pak rozvinuli diskusi o výzkumných infrastrukturách jako klíčových pilířích EOSC, a to napříč různými vědními oblastmi — od fyziky, přes společenské vědy a archeologii, až po bioinformatiku. Patrik Čechvala z Fyzikálního ústavu AV ČR představil, jak multimessengerové experimenty přispívají k poznání vesmíru, zatímco Ilona Trtíková z Českého sociálněvědního datového archivu (ČSDA) zdůraznila význam humanitních a společenských věd v datově řízeném výzkumu. O tom, jak může Evropa získat zpět webovou suverenitu díky otevřené a federativní infrastruktuře pro vyhledávání, analýzu a AI, hovořil ve své přednášce Stefan Voigt z Open Search Foundation. Umělá inteligence a data v praxi Druhý den konference se zaměřil na využití umělé inteligence ve výzkumu a budování evropské suverenity v oblasti AI. Vystoupil Vladimír Petrík (ČVUT) s příspěvkem o evropských open-source foundation modelech v projektu ELLIOT a Markus Koskela (CSC – IT Center for Science, Finsko), který přiblížil LUMI AI Factory – jednu z nejvýkonnějších AI infrastruktur v Evropě. Praktické příklady využití AI ve vědě pak nabídli například Tomáš Brázdil (MU) s prezentací o digitální patologii nebo Saltuk Eyrilmez (MU) s ukázkou generování dat pro vývoj léčiv pomocí kvantové mechaniky. Nechyběly ani příspěvky z oblasti bioimagingu, návrhu nových materiálů nebo podpory FAIR datových praktik. Vladimír Ulman (IT4Innovations a MU) v rámci projektu MIFA zdůraznil, že nezbytnou roli v rozvoji AI hraje dostupná infrastruktura: „Abychom mohli vyvíjet výkonné a univerzální AI metody pro bioobrazovou analýzu, potřebujeme rozsáhlé, různorodé a kvalitně anotované datasety. To ale vyžaduje čas, úsilí a investice. Zásadní roli proto hraje infrastruktura – bez FAIRových repozitářů a výkonných výpočetních zdrojů, což je obojí dostupné například prostřednictvím EOSC, se nám takové AI metody budou těžko vytvářet.„ Propojování komunit a sdílení know-howZávěrečná část konference nabídla paralelní praktické workshopy, včetně hands-on tréninku zaměřeného na FAIR data, nástroje a software. Uzavřené sezení pak umožnilo sdílení zkušeností mezi partnery Národní repozitářové platformy (NRP). Konference prokázala rostoucí význam výzkumných dat, otevřené vědy a mezinárodní spolupráce pro budoucnost vědeckého poznání a potvrdila, že se Česká republika profiluje jako aktivní partner evropské iniciativy EOSC, který přináší nejen odborné znalosti, ale i funkční model propojení politik, infrastruktur a výzkumných komunit. Kompletní program, prezentace přednášejících a video záznam konference bude k dispozici na webové stránce konference. Původní zdroj: tisková zpráva EOSC-CZ Author: Lucie Skřičková